Dok je Bosna i Hercegovina bila dio SFR Jugoslavije, Akademija nauka i umjetnosti Bosne i Hercegovine ostvarivala je međunarodnu saradnju putem Savjeta akademija Jugoslavije, a na osnovu protokola koje je Savjet zaključio sa drugim nacionalnim akademijama.
Nakon proglašenja Bosne i Hercgovine nezavisnom državom (1992), ANUBiH postaje nacionalna akademija.
Akademija je do sada obnovila i uspostavila naučnu saradnju sa nizom stranih akademija i međunarodnih institucija, među koje spadaju:
| Austrijska akademija nauka | www.oeaw.ac.at |
| Bugarska akademija nauka | www.bas.bg |
| Crnogorska akademija nauka i umjetnosti | www.canu.me/ |
| Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti | www.info.hazu.hr |
| Mađarska akademija nauka | www.mta.hu |
| Makedonska akademija nauka i umjetnosti | www.manu.edu.mk |
| Ruska akademija nauka | www.new.ras.ru |
| Slovenska akademija znanosti i umjetnosti | www.sazu.si |
| Turska akademija nauka | www.tuba.gov.tr |
| European Federation of National Academies of Sciences and Humanities (ALLEA) | www.allea.org |
| Euro Mediterranean Academic Network (GID-EMAN) | www.g-i-d.org |
| Global Network of Science Academies (IAP) | www.interacademies.org |
| Indian Council of Social Science Research (ICSSR) | www.icssr.org |
| Inter-University Center (IUC) Dubrovnik | www.iuc.hr |
| Inter-Academy Council of Southeast Europe (IAC SEE) | www.iacsee.ac.me |
| International Science Council (ISC) | www.council.science |
| International Union of Academies (IUA) | www.unionacademique.org |